サーバにntpdを入れたのにntpq -pコマンドなどで確認しても一向に時刻同期が始まらない場合、以下のようにntpdateコマンドを使用して手動で時刻を合わせる必要があります。
ntpdate -b -u [ntp server]
※bオプションは強制的な時刻合わせ、uオプションはファイヤーウォールなどでブロックされないようなポートを利用してパケットを出力するためのオプションらしいです。(manファイルより)
手動で時刻を合わせたらntpdサービスをリスタートします。しばらくしたら時刻同期が始まります。
もちろん、ファイヤーウォールやルータのポート開放も忘れずに!
以上